34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3455 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  55.84 
 
 		 236 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  55.02 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  56.96 
 
 		 236 aa  264  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  54.15 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  52.16 
 
 		 234 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  51.29 
 
 		 234 aa  256  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  53.02 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  49.57 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  49.14 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  49.78 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  48.92 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  46.32 
 
 		 245 aa  224  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  31.05 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  30.1 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  32.29 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  29.38 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  28.93 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  28.93 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  25.13 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  26.4 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  29.51 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  28.27 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  23.12 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  23.3 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  22.91 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  26.23 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  24.75 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  28.44 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  21.57 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  22.22 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  27.5 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.14 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  31.33 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>