32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  100 
 
 		 428 aa  870    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  33.97 
 
 		 473 aa  251  1e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  38.12 
 
 		 201 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  36.92 
 
 		 214 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  36.08 
 
 		 212 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  36.22 
 
 		 212 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  33.85 
 
 		 209 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  33.68 
 
 		 204 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  37.56 
 
 		 215 aa  109  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  27.81 
 
 		 204 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  29.15 
 
 		 207 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2290  uncharacterized membrane protein  31.58 
 
 		 219 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3450  uncharacterized membrane protein  38.46 
 
 		 225 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.218534  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0147  uncharacterized membrane protein  31.53 
 
 		 216 aa  97.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2664  protein of unknown function DUF161  30.88 
 
 		 220 aa  94.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15293e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  27.17 
 
 		 210 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0194  protein of unknown function DUF161  28.88 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  26.56 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  27.53 
 
 		 275 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  27.72 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  26.46 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1470  membrane protein-like  23.4 
 
 		 236 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148532  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  24.73 
 
 		 231 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  22.91 
 
 		 202 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  26.6 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  27.53 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  30.26 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  24.16 
 
 		 273 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  46.6  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  25 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  26.9 
 
 		 209 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  30.08 
 
 		 219 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>