28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1048 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  46.19 
 
 
473 aa  177  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  41.97 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  42.49 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  41.45 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2664  protein of unknown function DUF161  39.23 
 
 
220 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15293e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0147  uncharacterized membrane protein  39.58 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108653  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3450  uncharacterized membrane protein  41.36 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.218534  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0194  protein of unknown function DUF161  37.97 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2290  uncharacterized membrane protein  37.56 
 
 
219 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  37.56 
 
 
428 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1470  membrane protein-like  30.77 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148532  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  28.49 
 
 
202 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0550  hypothetical protein  28.75 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000633866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  24.02 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  22.97 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  22.97 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1760  membrane spanning protein  23.5 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  22.93 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  22.93 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  22.93 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  22.93 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  23.41 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  22.93 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  26.22 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  28.57 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  22.44 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  26.01 
 
 
206 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>