28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2290 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2290  uncharacterized membrane protein  100 
 
 
219 aa  422  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0147  uncharacterized membrane protein  55.5 
 
 
216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108653  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3450  uncharacterized membrane protein  54.76 
 
 
225 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.218534  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  37.56 
 
 
215 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2664  protein of unknown function DUF161  38.12 
 
 
220 aa  119  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15293e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  36.04 
 
 
473 aa  118  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  35.26 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  33.84 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  35.53 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0194  protein of unknown function DUF161  36.41 
 
 
214 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414884 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  31.58 
 
 
428 aa  101  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1470  membrane protein-like  33.85 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148532  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  32.04 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0550  hypothetical protein  29.01 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000633866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  27.38 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  25.98 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  27.21 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  25.49 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  25.49 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  26.62 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  26.47 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  27.93 
 
 
206 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  24.26 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  27.98 
 
 
243 aa  45.1  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  23.4 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1760  membrane spanning protein  23.97 
 
 
208 aa  42  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  28.32 
 
 
208 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>