74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5957 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  65.76 
 
 
228 aa  234  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  57.67 
 
 
287 aa  207  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  64.13 
 
 
244 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  58.01 
 
 
224 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  56.59 
 
 
234 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  55.03 
 
 
203 aa  187  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  58.48 
 
 
209 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  54.04 
 
 
256 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  50.8 
 
 
227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  52.94 
 
 
214 aa  181  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  65.95 
 
 
218 aa  177  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  65.41 
 
 
218 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  54.8 
 
 
295 aa  174  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  51.98 
 
 
213 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  57.07 
 
 
220 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  54.55 
 
 
238 aa  168  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  53.48 
 
 
234 aa  167  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  56.28 
 
 
233 aa  165  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  53.68 
 
 
241 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  55.09 
 
 
258 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  53.04 
 
 
213 aa  157  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  52.22 
 
 
219 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  57.23 
 
 
226 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  57.23 
 
 
226 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  57.23 
 
 
226 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  56.41 
 
 
209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  50.8 
 
 
228 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  44.02 
 
 
211 aa  142  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  44.32 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  46.11 
 
 
217 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  38.89 
 
 
249 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  40.44 
 
 
218 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  39.11 
 
 
225 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  40.22 
 
 
222 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  37.11 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  36.65 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  36.65 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  36.65 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  36.65 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  37.11 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  36.65 
 
 
214 aa  84.7  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  36.02 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  36.02 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  31.69 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  31.69 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  31.15 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  31.15 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  30.05 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  30.6 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  30.05 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  28.65 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  28.65 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  34.43 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  24.32 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  29.9 
 
 
243 aa  61.6  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  27.96 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5532  hypothetical protein  26.78 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5255  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5498  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5653  hypothetical protein  26.63 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5526  hypothetical protein  25.97 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  25.14 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  25.14 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5582  hypothetical protein  25.97 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  25.97 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5196  hypothetical protein  25.97 
 
 
208 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225091  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  24.75 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  24.47 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  25.28 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0973  hypothetical protein  25.25 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0948172  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  26.26 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  25.25 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0871  hypothetical protein  25.78 
 
 
208 aa  42  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>