16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0194 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0194  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
214 aa  417  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414884 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2664  protein of unknown function DUF161  38.24 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15293e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  38 
 
 
214 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0147  uncharacterized membrane protein  39.9 
 
 
216 aa  121  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108653  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  37.97 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  37.06 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3450  uncharacterized membrane protein  36.95 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.218534  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  35.48 
 
 
473 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  37.06 
 
 
212 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2290  uncharacterized membrane protein  36.41 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1470  membrane protein-like  27.27 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148532  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  30.48 
 
 
428 aa  77  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  24.61 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0550  hypothetical protein  27.91 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000633866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1760  membrane spanning protein  20.87 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  27.5 
 
 
211 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>