30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3450 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3450  uncharacterized membrane protein  100 
 
 
225 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.218534  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2290  uncharacterized membrane protein  54.76 
 
 
219 aa  201  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0147  uncharacterized membrane protein  50.24 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108653  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  40.31 
 
 
473 aa  142  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  41.36 
 
 
215 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  41.71 
 
 
212 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2664  protein of unknown function DUF161  39.32 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15293e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  39.7 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  41.03 
 
 
214 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0194  protein of unknown function DUF161  36.95 
 
 
214 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414884 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  36.54 
 
 
428 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1470  membrane protein-like  26.7 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148532  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  28.42 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0550  hypothetical protein  29.19 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000633866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  26.83 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  26.67 
 
 
208 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5582  hypothetical protein  26.67 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5526  hypothetical protein  26.67 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5196  hypothetical protein  26.67 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  26.67 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  26.06 
 
 
208 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5498  hypothetical protein  26.58 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5653  hypothetical protein  26.58 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5255  hypothetical protein  26.58 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5532  hypothetical protein  26.97 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  29.56 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  21.15 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  25.31 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  26.96 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11077  sugar O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03380)  28 
 
 
222 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>