32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0394 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  88.68 
 
 
212 aa  377  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  83.89 
 
 
214 aa  363  1e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  46.77 
 
 
473 aa  195  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  41.97 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2664  protein of unknown function DUF161  41.87 
 
 
220 aa  161  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15293e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0147  uncharacterized membrane protein  38.95 
 
 
216 aa  125  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108653  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3450  uncharacterized membrane protein  41.71 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.218534  normal  0.0629267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  36.08 
 
 
428 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0194  protein of unknown function DUF161  37.24 
 
 
214 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414884 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2290  uncharacterized membrane protein  35.26 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  31.87 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1470  membrane protein-like  26.87 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0148532  normal  0.115701 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0550  hypothetical protein  27.84 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000633866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  28.5 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  22.33 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  21.9 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  22.56 
 
 
221 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  22.33 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  22.56 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  22.56 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  22.33 
 
 
221 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0871  hypothetical protein  26.06 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1760  membrane spanning protein  25.26 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  25.62 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  25.12 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  25.25 
 
 
256 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  25.41 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  20.87 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  25.25 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  27.5 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  22.56 
 
 
213 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>