42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0106 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  38.05 
 
 
204 aa  145  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  35.38 
 
 
209 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  34.85 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  38.12 
 
 
428 aa  124  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  29.9 
 
 
207 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  34.07 
 
 
473 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  30.14 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  30.5 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  27.81 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  27.12 
 
 
271 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  27.12 
 
 
271 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  28.22 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  27.69 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  25.37 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  26.87 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  27.55 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  27.27 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  26.29 
 
 
273 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  23.91 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  24.16 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  24.16 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  20.97 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  24.61 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  25.37 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  24.74 
 
 
276 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  23.59 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  24.63 
 
 
278 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  22.84 
 
 
252 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  25.41 
 
 
229 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  23.81 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  24.14 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  22.12 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  23.37 
 
 
237 aa  44.7  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  26.67 
 
 
219 aa  44.7  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  24.04 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  25.64 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  24.73 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  24.53 
 
 
242 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  25 
 
 
278 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  22.28 
 
 
181 aa  41.6  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>