22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3022 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  564  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  32.91 
 
 		 229 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  28.19 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  28.18 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  23.81 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  28 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  26.36 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  24.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  25.94 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  31.67 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  26.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  25.53 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  25.77 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  29.57 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.74 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  27.5 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  26.37 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  25.13 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  26.98 
 
 		 238 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  27.49 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  24.53 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  23.12 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>