22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0517 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  477  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  34.72 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  28.19 
 
 
276 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  25.53 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  23.76 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  26.4 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  27.01 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  25.14 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  24.58 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  24.73 
 
 
428 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.16 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  25.9 
 
 
473 aa  52.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  28 
 
 
234 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  23.92 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  23.16 
 
 
209 aa  52  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  25.25 
 
 
204 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  25.65 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  26.21 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  21.84 
 
 
209 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  24.72 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  22.8 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>