30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1486 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  86.21 
 
 
234 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  59.05 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  51.29 
 
 
231 aa  256  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  48.29 
 
 
236 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  45.45 
 
 
236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  44.44 
 
 
245 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  48.28 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  42.92 
 
 
238 aa  221  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  43.16 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  43.78 
 
 
238 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  43.86 
 
 
229 aa  214  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  27.78 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  26.04 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  26.63 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  26.42 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  27.04 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  24.61 
 
 
210 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  24.86 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.1 
 
 
275 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  28.33 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  28 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  22.28 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  28.24 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  24.18 
 
 
229 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  23.81 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  21.84 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  20.21 
 
 
310 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>