26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1485 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  86.21 
 
 
234 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  58.12 
 
 
252 aa  300  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  52.16 
 
 
231 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  49.57 
 
 
236 aa  254  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  46.35 
 
 
236 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  45.73 
 
 
238 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  46.15 
 
 
238 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  48.28 
 
 
236 aa  225  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  43.72 
 
 
245 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  44.64 
 
 
229 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  43.53 
 
 
234 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  43.1 
 
 
234 aa  215  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  24.87 
 
 
273 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  25 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  23.96 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  24.46 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  31.25 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  25.74 
 
 
275 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  24.74 
 
 
210 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  26.21 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  23.33 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  25 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  22.58 
 
 
204 aa  45.1  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  22.4 
 
 
275 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  20.83 
 
 
310 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>