30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0357 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  484  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  96.15 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  64.5 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  59.83 
 
 		 245 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  49.57 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  47.84 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  45.69 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  43.16 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  44.4 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  43.53 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  43.97 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  43.16 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  25.35 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  26.84 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  24.61 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  26 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  23.91 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  23.9 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  25.14 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  23.37 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  23.04 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  24.1 
 
 		 273 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  22.53 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  25.41 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  23.33 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  22.49 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  21.76 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  19.79 
 
 		 310 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>