33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0672 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  65.68 
 
 		 236 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  55.84 
 
 		 231 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  51.29 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  51.08 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  49.57 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  48.29 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  46.44 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  46.86 
 
 		 238 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  44.02 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  45.45 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  43.59 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  44.02 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  28.92 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  25.13 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  26.53 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  26.06 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  26.53 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  23.04 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  26.29 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  25.39 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  22.97 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  27.96 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  24.44 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  29.51 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  25.56 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  23.96 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  23.2 
 
 		 310 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  25.37 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  24.04 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 271 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  21.58 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>