74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1979 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  70.59 
 
 		 273 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  66.67 
 
 		 273 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  64.1 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  62.64 
 
 		 271 aa  358  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  60.81 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  57.88 
 
 		 275 aa  324  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  26.3 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  27.34 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  30.1 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  29.47 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  28.42 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  25.25 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  26.42 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  24.07 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  28.57 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  24.24 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  25.24 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  24.76 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  26.06 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  28.12 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  24.88 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  28.27 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  23.94 
 
 		 202 aa  62  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  26.84 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  27.08 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  24.87 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  23.91 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  29.67 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2397  hypothetical protein  23.11 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  24.74 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  24.06 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  26.67 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  23.76 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  21.72 
 
 		 207 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  31.41 
 
 		 187 aa  48.9  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  23.3 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  25.56 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  29.82 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  28.74 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  25 
 
 		 428 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3436  transport-associated  28.57 
 
 		 127 aa  46.2  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.865751  normal  0.0604848 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  28.25 
 
 		 184 aa  45.8  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  31.08 
 
 		 201 aa  45.8  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2047  transport-associated protein  29.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  24.59 
 
 		 182 aa  45.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  31.08 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  24.31 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  31.08 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  31.08 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  31.08 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5083  transport-associated protein  32.89 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  31.08 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  31.08 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  31.08 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  31.08 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.08 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  25.77 
 
 		 175 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  30 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  23.71 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  35.48 
 
 		 112 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1170  phospholipid binding protein  29.17 
 
 		 112 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191898 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  31.34 
 
 		 116 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  31.43 
 
 		 158 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  28.57 
 
 		 184 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  30.88 
 
 		 192 aa  42.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>