30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2837 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  490  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  65.68 
 
 		 236 aa  340  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  56.96 
 
 		 231 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  52.59 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  52.23 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  52.21 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  47.86 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  48.28 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  47.64 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  46.81 
 
 		 236 aa  228  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  43.04 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  43.59 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  43.16 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  28.95 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  27.08 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  25.91 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  25.91 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  27.22 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  26.98 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  26.04 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  25.81 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  25.63 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  23.27 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.48 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  22.56 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  23.76 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  23.96 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  24.04 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1336  hypothetical protein  24.64 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  22.92 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>