40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3811 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  92.86 
 
 		 238 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  54.15 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0672  hypothetical protein  46.86 
 
 		 236 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0471907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  46.58 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1485  hypothetical protein  46.15 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  47.62 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2837  hypothetical protein  52.21 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000106697  hitchhiker  2.88656e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  45.69 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0357  hypothetical protein  45.69 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000646753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1486  hypothetical protein  43.78 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2332  hypothetical protein  44.21 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1793  hypothetical protein  43.1 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000475363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  32.83 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  27.47 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  24.54 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  26.92 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  29.47 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  27.32 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  26.84 
 
 		 275 aa  72  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  22 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  25.41 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  24.27 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  26.48 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  24.1 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  25.53 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  25.37 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  25.49 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  21.08 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  25.14 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  23.46 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  26.77 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  21.72 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  20.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3022  hypothetical protein  26.98 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  19.8 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  23.16 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  25.5 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  28 
 
 		 180 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  23.36 
 
 		 240 aa  42  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>