46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0468 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  63.79 
 
 
181 aa  220  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  61.99 
 
 
182 aa  218  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  60 
 
 
178 aa  210  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  57.47 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  50 
 
 
180 aa  175  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  53.8 
 
 
175 aa  164  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  45.14 
 
 
172 aa  142  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  45.91 
 
 
192 aa  141  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  46.91 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  45.03 
 
 
192 aa  134  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  45.28 
 
 
191 aa  134  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  43.18 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  39.63 
 
 
189 aa  124  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  40 
 
 
179 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  42.6 
 
 
203 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  40 
 
 
184 aa  112  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  38.24 
 
 
180 aa  111  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  38.85 
 
 
181 aa  107  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  38.04 
 
 
204 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  37.65 
 
 
178 aa  104  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  38.04 
 
 
184 aa  104  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  33.53 
 
 
187 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  36.25 
 
 
184 aa  100  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  39.38 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  36.81 
 
 
178 aa  97.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  34.97 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  36.2 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  38.51 
 
 
174 aa  94.4  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  27.03 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  31.25 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  29.8 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  29.01 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  27.11 
 
 
327 aa  67.4  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  28.12 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0661  adenylate kinase  55.26 
 
 
213 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00942605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  25.5 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0128  cytidylate kinase  24.04 
 
 
221 aa  42  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0246  adenylate kinase  43.9 
 
 
213 aa  41.6  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  32.43 
 
 
216 aa  41.6  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  25 
 
 
218 aa  41.2  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  24.68 
 
 
212 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  37.04 
 
 
217 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2150  cytidylate kinase region  38.3 
 
 
246 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.332782  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3245  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  34.09 
 
 
313 aa  40.8  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000483334  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  32.1 
 
 
219 aa  40.8  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>