19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2391 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  471  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  58.55 
 
 
242 aa  254  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  58.56 
 
 
209 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  53.88 
 
 
209 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  54.63 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  46.29 
 
 
210 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  28.07 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  24.4 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  21.83 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  23.83 
 
 
210 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  28.97 
 
 
202 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  22.73 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  23.92 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  22.48 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  24.44 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  22.12 
 
 
201 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  21.03 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  26.72 
 
 
428 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  23.36 
 
 
238 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>