33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1705 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  66.83 
 
 		 209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  62.39 
 
 		 219 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  58.56 
 
 		 240 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  53.88 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  49.76 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  28.71 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  28.37 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  26.21 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  27.67 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  28.08 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  28.22 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  21.95 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  24.12 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  26.24 
 
 		 473 aa  62.8  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  25.49 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  25.49 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  26.6 
 
 		 428 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  22.55 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  27.72 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  26.67 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  17.71 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  23.41 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  21.95 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  22.33 
 
 		 271 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  21.78 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  22.33 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0377  hypothetical protein  26.37 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3455  hypothetical protein  31.33 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  27.18 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  23.19 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  24.23 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  22.46 
 
 		 229 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>