35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0922 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1705  hypothetical protein  66.83 
 
 
209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2391  hypothetical protein  53.88 
 
 
240 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3885  hypothetical protein  54.17 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0365  hypothetical protein  51.14 
 
 
242 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0656462  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4038  hypothetical protein  47.34 
 
 
210 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  24.19 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  23 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  25.37 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3706  hypothetical protein  25.87 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  24.51 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3903  hypothetical protein  26.96 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00027123  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0658  putative cytidylate kinase  24.12 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  25.12 
 
 
278 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0569  cytidylate kinase  21.33 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  25.37 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1957  membrane protein-like protein  23.9 
 
 
473 aa  55.1  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.217761  hitchhiker  0.00755155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  21.74 
 
 
229 aa  54.7  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  24.4 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  20.31 
 
 
310 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3716  hypothetical protein  23.9 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  21.84 
 
 
271 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  22.82 
 
 
273 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  21.84 
 
 
271 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0517  hypothetical protein  21.84 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  23.3 
 
 
273 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  20.9 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0288  hypothetical protein  28.05 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.511661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  21.57 
 
 
275 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2444  putative cytidylate kinase  26 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2646  hypothetical protein  28.4 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  24.27 
 
 
275 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  26.9 
 
 
428 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  24.41 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1653  hypothetical protein  22.17 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000117481  normal  0.338305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>