24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1509 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1509  response regulator receiver protein  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00063151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  50.2 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  32.32 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  29.8 
 
 		 406 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  32.32 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2397  hypothetical protein  29.3 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 411 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2809  transport-associated protein  29.77 
 
 		 273 aa  89  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00612028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  27.48 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4490  transport-associated  27.55 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  26.17 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0009  hypothetical protein  26.97 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  27.62 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0901  putative cytidylate kinase, putative  26.09 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00118892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  24.77 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0922  hypothetical protein  25.12 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2798  transport-associated  26.42 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549341  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2114  hypothetical protein  24.62 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000150815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  24.74 
 
 		 209 aa  49.3  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1652  hypothetical protein  25.29 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202399  normal  0.336802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0168  putative hypoxanthine phosphoribosyl transferase with additional GAF motif  21.17 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3811  hypothetical protein  23.16 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20820  predicted membrane protein  25.42 
 
 		 428 aa  42  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>