115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2321 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  72.92 
 
 
192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  66.67 
 
 
192 aa  264  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  65.62 
 
 
191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  62.9 
 
 
191 aa  238  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  49.19 
 
 
203 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  48.65 
 
 
204 aa  168  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  50.29 
 
 
172 aa  159  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  43.27 
 
 
179 aa  150  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  43.18 
 
 
180 aa  150  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  48.73 
 
 
175 aa  148  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  45.09 
 
 
177 aa  142  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  45.03 
 
 
176 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  34.62 
 
 
189 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  42.86 
 
 
180 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  42.11 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  39.88 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  39.33 
 
 
178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  39.66 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  40.8 
 
 
178 aa  128  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  42.67 
 
 
178 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  39.16 
 
 
181 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  40.76 
 
 
178 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  40.76 
 
 
178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  41.51 
 
 
184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  39.1 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  39.62 
 
 
184 aa  115  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  38.36 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  40.25 
 
 
184 aa  104  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  36.87 
 
 
327 aa  94.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  30.57 
 
 
251 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  31.58 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  35.75 
 
 
327 aa  88.2  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  27.07 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  32.16 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  31.08 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0661  transport-associated  26.26 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  30.41 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  28.29 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  24.32 
 
 
529 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  50 
 
 
216 aa  51.6  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  28.57 
 
 
222 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  25.52 
 
 
213 aa  49.3  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2381  cytidylate kinase-like  25.26 
 
 
242 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0882495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.37 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  27.32 
 
 
275 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2196  cytidylate kinase  48.72 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1067  dephospho-CoA kinase  25.95 
 
 
193 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  24.16 
 
 
226 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0128  cytidylate kinase  24.71 
 
 
221 aa  47  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  48.15 
 
 
195 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0106  cytidylate kinase  27.04 
 
 
201 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1911  transport-associated protein  29.12 
 
 
271 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.551319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  26.26 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2312  transport-associated  28.21 
 
 
271 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000102264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  29.3 
 
 
264 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  28.17 
 
 
212 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  45.83 
 
 
223 aa  45.1  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  35.71 
 
 
232 aa  44.7  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  45.83 
 
 
227 aa  44.7  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0403  cytidylate kinase  23.94 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  55.56 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  55.56 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  55.56 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  30.61 
 
 
699 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  46.81 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2238  cytidylate kinase  52.63 
 
 
230 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000316854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  44.23 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  43.59 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  26.55 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0587  hypothetical protein  31.86 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618354  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  25.95 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  42.59 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  38.33 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  52.63 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  26.97 
 
 
168 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  43.59 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  46.15 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.03 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  42.62 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  38.89 
 
 
221 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1351  cytidylate kinase region  28.57 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3378  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.54 
 
 
230 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0070721  normal  0.306738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3842  hypothetical protein  31.54 
 
 
176 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  25.82 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0286  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  40 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626987  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0349  cytidylate kinase  23.31 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.229636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  46.81 
 
 
214 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  33.75 
 
 
217 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  38.6 
 
 
216 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  33.75 
 
 
217 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  38.6 
 
 
216 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  47.37 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  31.37 
 
 
187 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  31.37 
 
 
187 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  50 
 
 
229 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  47.37 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  51.28 
 
 
811 aa  42  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3248  hypothetical protein  27.97 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  36.84 
 
 
232 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>