53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1945 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  100 
 
 
203 aa  414  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  65.62 
 
 
204 aa  259  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  50.26 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  51.35 
 
 
191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  48.95 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  47.03 
 
 
192 aa  165  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  49.19 
 
 
192 aa  162  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  40.34 
 
 
180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  41.48 
 
 
182 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  42.6 
 
 
176 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  39.43 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  38.86 
 
 
178 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  42.77 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  35.8 
 
 
175 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  36.52 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  39.43 
 
 
181 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  31.58 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  37.74 
 
 
179 aa  108  7.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  38.75 
 
 
174 aa  106  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  36.25 
 
 
178 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  36.25 
 
 
178 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  36.52 
 
 
187 aa  104  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  36.25 
 
 
178 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  35.62 
 
 
178 aa  95.5  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  36.25 
 
 
184 aa  91.3  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  33.54 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  34.16 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  32.5 
 
 
184 aa  84.7  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  30.86 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  32.91 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  26.34 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  29.83 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  27.53 
 
 
327 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  26.38 
 
 
327 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  24.35 
 
 
251 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  51.35 
 
 
232 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0909  cytidylate kinase  50 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  45.71 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  45.71 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  45.71 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  29.41 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  29.41 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  40 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  48.72 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  24.21 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  28.23 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0694  dephospho-CoA kinase  37.25 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  29.89 
 
 
217 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0955  hypothetical protein  51.52 
 
 
183 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0123  cytidylate kinase  21.74 
 
 
222 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651888  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  44.12 
 
 
184 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  26.72 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  42.11 
 
 
221 aa  41.6  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>