38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2227 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  58.19 
 
 
182 aa  216  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  60 
 
 
176 aa  210  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  56.18 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  52.25 
 
 
177 aa  182  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  48.89 
 
 
180 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  56.96 
 
 
175 aa  175  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  45.71 
 
 
172 aa  142  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  39.33 
 
 
192 aa  137  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  39.77 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  38.07 
 
 
191 aa  127  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  38.15 
 
 
191 aa  125  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  39.41 
 
 
179 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  39.33 
 
 
192 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  38.86 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  38.12 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  36.02 
 
 
178 aa  112  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  38.75 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  39.38 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  36.25 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  38.75 
 
 
178 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  38.85 
 
 
174 aa  108  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  37.5 
 
 
184 aa  108  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  35.15 
 
 
189 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  35.43 
 
 
204 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  38.51 
 
 
184 aa  104  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  34.12 
 
 
187 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  35.43 
 
 
181 aa  98.6  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  34.55 
 
 
180 aa  90.9  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  31.29 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  27.59 
 
 
251 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  28.8 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  32.3 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  29.75 
 
 
327 aa  68.2  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  29.75 
 
 
327 aa  67  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0813  hypothetical protein  24.04 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00430101  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0311  hypothetical protein  45.45 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.677562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0527  hypothetical protein  43.18 
 
 
183 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.986919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>