40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0083 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  100 
 
 
180 aa  361  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  61.14 
 
 
175 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  48.89 
 
 
178 aa  176  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  50 
 
 
176 aa  175  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  46.59 
 
 
182 aa  168  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  48.33 
 
 
181 aa  162  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  46.33 
 
 
177 aa  157  9e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  47.16 
 
 
172 aa  148  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  46.78 
 
 
179 aa  145  3e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  44.32 
 
 
192 aa  141  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  41.14 
 
 
192 aa  137  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  41.62 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  41.95 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  42.86 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  40.34 
 
 
203 aa  125  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  46.3 
 
 
178 aa  124  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  48.12 
 
 
174 aa  123  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  45.68 
 
 
178 aa  123  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  46.63 
 
 
178 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  40.11 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  42.14 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  38.67 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  38.32 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  36.36 
 
 
189 aa  105  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  37.14 
 
 
184 aa  105  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  36 
 
 
184 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  35.26 
 
 
187 aa  100  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  36 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  33.14 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  35.39 
 
 
180 aa  89  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  28.96 
 
 
327 aa  84.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  30 
 
 
327 aa  84.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  31.76 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  26.83 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  25.53 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1325  transport-associated protein  25.82 
 
 
275 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0768925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  24.75 
 
 
529 aa  45.1  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  44.44 
 
 
191 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  43.9 
 
 
216 aa  41.2  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3531  hypothetical protein  25.91 
 
 
209 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0110536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>