More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0478 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  100 
 
 		 207 aa  416  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0123  cytidylate kinase  54.19 
 
 		 222 aa  215  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2220  cytidylate kinase  49.5 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0760  cytidylate kinase  40.38 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  38.86 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1452  cytidylate kinase  36.92 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.437148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  38.21 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  37.96 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  36.97 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  36.77 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  35.51 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  36.92 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  38.1 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  34.93 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  39.17 
 
 		 229 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  39.45 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 230 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 230 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  39.09 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  34.6 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  34.25 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  37.73 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  33.79 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  36.74 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 231 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 225 aa  124  9e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1507  cytidylate kinase  34.45 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  36.82 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  38.07 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  37.38 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  38.89 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  39.44 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  37.91 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 228 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  39.25 
 
 		 699 aa  121  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  35.81 
 
 		 219 aa  121  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 255 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  36.7 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  35.87 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  38.32 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  35.58 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  36.74 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  38.79 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  38.12 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  32.73 
 
 		 228 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  37.5 
 
 		 229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  38.31 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  36.41 
 
 		 229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 229 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  33.64 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  34.76 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  35.81 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  37.8 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  36.28 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0508  cytidylate kinase  33.64 
 
 		 221 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  35.27 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  39.72 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>