More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0123 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0123  cytidylate kinase  100 
 
 
222 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651888  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  54.19 
 
 
207 aa  215  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2220  cytidylate kinase  50.49 
 
 
209 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  37.14 
 
 
227 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  34.6 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  38.5 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  37.93 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  40 
 
 
222 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  40.95 
 
 
213 aa  138  7.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  36.49 
 
 
226 aa  136  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  36.87 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  34.88 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  40.19 
 
 
233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  38.32 
 
 
229 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  38.99 
 
 
223 aa  131  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  37.91 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  36.24 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  33.17 
 
 
213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  38.1 
 
 
225 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  36.74 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  36.92 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  37.38 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  34.91 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  33.96 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  35.98 
 
 
230 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  36.41 
 
 
229 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  36.36 
 
 
221 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  37.96 
 
 
227 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0128  cytidylate kinase  34.1 
 
 
221 aa  123  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  36.41 
 
 
230 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  36.41 
 
 
230 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  36.41 
 
 
230 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0324  cytidylate kinase  35.65 
 
 
244 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  39.81 
 
 
224 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  38.1 
 
 
228 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  32.13 
 
 
233 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  33.49 
 
 
229 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  38.1 
 
 
228 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  33.65 
 
 
219 aa  122  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  38.1 
 
 
228 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  37.79 
 
 
229 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  36.79 
 
 
227 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1507  cytidylate kinase  35.29 
 
 
209 aa  122  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  35.02 
 
 
227 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  38.32 
 
 
229 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  33.33 
 
 
223 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  36.87 
 
 
229 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  33.8 
 
 
231 aa  121  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  33.65 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  37.85 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  34.7 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  35.94 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  37.85 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  37.85 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  35.94 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  37.5 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  36.61 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  31.67 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  34.7 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  37.85 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  37.85 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  35.94 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  35.94 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  36.74 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  33.49 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  37.85 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  34.26 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  35.94 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  37.33 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  37.61 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  37.61 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  32.86 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  34.76 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  34.76 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  34.76 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  34.76 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  34.29 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  34.76 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  34.76 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  34.76 
 
 
225 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  36.16 
 
 
699 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  35.94 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  37.21 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  36.32 
 
 
221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  37.21 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  37.85 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  37.21 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  37.21 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  36.28 
 
 
221 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  34.1 
 
 
230 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.39 
 
 
653 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  34.91 
 
 
226 aa  118  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  37.61 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1953  cytidylate kinase  33.02 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  34.29 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.74 
 
 
528 aa  117  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  34.29 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  37.74 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  35.05 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  33.8 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>