More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1507 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1507  cytidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  42.72 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  34.84 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  38.71 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  35.29 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  34.43 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  36.45 
 
 		 251 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  34.35 
 
 		 511 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  33.91 
 
 		 511 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  35.16 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  36.45 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  39.53 
 
 		 231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  36.79 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  38.14 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  38.12 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  37.07 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  35.51 
 
 		 250 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40 
 
 		 516 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  33.79 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  37.14 
 
 		 227 aa  131  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  38.86 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  32.41 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.52 
 
 		 516 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  34.3 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  36.41 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  36.11 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  33.03 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  36.74 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  34.11 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  34.09 
 
 		 225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  36.84 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  36.84 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  36.79 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  34.23 
 
 		 237 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  35.19 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  37.62 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  36.41 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  33.94 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  33.94 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  32.58 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  33.94 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  36.7 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  37.38 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  34.72 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  34.23 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  34.1 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  32.42 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  32.42 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  32.42 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  32.42 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  35.98 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  34.1 
 
 		 228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  32.88 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  34.38 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.32 
 
 		 529 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  36.07 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  34.4 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  34.3 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.1 
 
 		 517 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  36.74 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  35.58 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  34.51 
 
 		 539 aa  124  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  35.19 
 
 		 218 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  34.45 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  31.39 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  35.68 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  34.56 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  35.55 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  35.24 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  33.18 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  35.27 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  36.11 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  33.48 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  32.27 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  34.84 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  34.76 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  33.8 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  33.94 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  37.79 
 
 		 514 aa  122  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0123  cytidylate kinase  35.29 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  34.8 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  33.8 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  33.8 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  33.8 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  35.68 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  33.8 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  34.29 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  34.29 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  33.49 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  32.27 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  35.98 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>