More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2220 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2220  cytidylate kinase  100 
 
 		 209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0123  cytidylate kinase  50.49 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  49.5 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  37.56 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1213  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.7 
 
 		 529 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  38.01 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  35.71 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  36.57 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  34.43 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  37.61 
 
 		 514 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  39.22 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  32.54 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  35.35 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  39.72 
 
 		 675 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  37.85 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  40.44 
 
 		 237 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  33.49 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  36.82 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.77 
 
 		 534 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.11 
 
 		 528 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  40 
 
 		 539 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  36.97 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  34.76 
 
 		 227 aa  111  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  38.28 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  37.22 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  35.02 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl198  putative cytidylate kinase  27.44 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0604738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  37.73 
 
 		 705 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.64 
 
 		 679 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  36.82 
 
 		 673 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  36.82 
 
 		 673 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  42.11 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0578  cytidylate kinase  25.93 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 268 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.56 
 
 		 526 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  40 
 
 		 653 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  35.65 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  37.5 
 
 		 527 aa  107  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  37.61 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  35.87 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1965  cytidylate kinase  34.25 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  37.61 
 
 		 699 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  35.94 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  32.09 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  32.21 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  36.54 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  36.54 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  36.54 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  37.73 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  33.01 
 
 		 224 aa  104  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  36.57 
 
 		 667 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  38.57 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  34.53 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.78 
 
 		 483 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.99 
 
 		 480 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  37.44 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  36.11 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  34.98 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.19 
 
 		 517 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  38.21 
 
 		 674 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  36.82 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  34.06 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  35.19 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  40.19 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  36.32 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  31.19 
 
 		 231 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  40.1 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  32.73 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  39.9 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  32.71 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  34.68 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  33.03 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  35.35 
 
 		 529 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  36.02 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  34.72 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  35.55 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  39.25 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  33.96 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  35.98 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  32.7 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  35.68 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  30.88 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  35.78 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  35.07 
 
 		 232 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  35.43 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  30.43 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  35.43 
 
 		 230 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  28.16 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  35.21 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1197  cytidylate kinase  33.64 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  35.87 
 
 		 230 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  35.87 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  34.26 
 
 		 237 aa  98.2  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  34.09 
 
 		 237 aa  98.2  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>