215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0399 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  77.72 
 
 		 184 aa  318  1.9999999999999998e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  75.54 
 
 		 184 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  75 
 
 		 184 aa  300  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  52.81 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  52.83 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  46.55 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  47.47 
 
 		 180 aa  147  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  44.71 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  40.41 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  38.75 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  39.1 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  37.64 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  39.1 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  38.69 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  37.21 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  39.63 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  39.38 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  40.6 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  36.97 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  37.18 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  37.76 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  36 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  37.06 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  36.36 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 187 aa  98.2  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  33.71 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  30.43 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  34.88 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  33.12 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  28.5 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  27.14 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  28.75 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  26.19 
 
 		 212 aa  62  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  29.77 
 
 		 268 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  28.12 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0478  cytidylate kinase  24.88 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  23.31 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  27.23 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  29.95 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  25.55 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  25.6 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  26.51 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  27.42 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  27.42 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  27.42 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  35.16 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  25.23 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  25.86 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  24.42 
 
 		 514 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  25.12 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  27.75 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  26.58 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  27.35 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  25.24 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  26.64 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1979  transport-associated protein  30.81 
 
 		 273 aa  51.2  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000154767  normal  0.0601452 
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  25 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  26.39 
 
 		 811 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  24.56 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  25.55 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  24.74 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  25.55 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  26.64 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  26.64 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  24.6 
 
 		 511 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  24.74 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  26.42 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  23.21 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  26.34 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2398  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1925  transport-associated domain-containing protein  30.81 
 
 		 273 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  25.81 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  23.08 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  24.66 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  25.81 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  26.28 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  24.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  22.87 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  24.06 
 
 		 511 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  23.58 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  23.58 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  25.81 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  23.58 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  27.62 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2220  cytidylate kinase  28.43 
 
 		 209 aa  47.8  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  27.81 
 
 		 517 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  24.31 
 
 		 227 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf302  cytidylate kinase  24.19 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.245847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>