26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0955 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0955  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  373  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0398  hypothetical protein  51.4 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2952  hypothetical protein  84.21 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  24.19 
 
 		 544 aa  48.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  24.66 
 
 		 520 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  21.47 
 
 		 520 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  21.88 
 
 		 520 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  26.92 
 
 		 490 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  23.35 
 
 		 525 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  25.4 
 
 		 513 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  25.4 
 
 		 513 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  45 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2403  hypothetical protein  48.78 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  26.24 
 
 		 519 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0597  hypothetical protein  31.62 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  25.76 
 
 		 530 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  30.94 
 
 		 498 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  26.95 
 
 		 420 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  51.52 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  38.71 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 527 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  31.46 
 
 		 533 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  42.5 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2287  hypothetical protein  29.23 
 
 		 268 aa  41.6  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2503  chloramphenicol phosphotransferase family protein  25.56 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  43.08 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>