148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1232 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  64.19 
 
 		 527 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1069    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  55.94 
 
 		 520 aa  591  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  53.92 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  53.54 
 
 		 518 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  51.73 
 
 		 519 aa  518  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  46.35 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  41.13 
 
 		 520 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  42.14 
 
 		 521 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  41.05 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  40.78 
 
 		 520 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  35.96 
 
 		 527 aa  322  8e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  33.86 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  36.36 
 
 		 520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  35.9 
 
 		 551 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  35.55 
 
 		 520 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  35.99 
 
 		 533 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  36.23 
 
 		 523 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  35.25 
 
 		 520 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  34.13 
 
 		 504 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  35.34 
 
 		 518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  36.2 
 
 		 516 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  35.06 
 
 		 520 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  36.31 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  35.61 
 
 		 518 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  35.39 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  36.08 
 
 		 520 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  35.58 
 
 		 513 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  33.99 
 
 		 508 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  35.63 
 
 		 508 aa  296  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  34.16 
 
 		 556 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  35.7 
 
 		 533 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  35.11 
 
 		 518 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  35.5 
 
 		 520 aa  293  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  35.07 
 
 		 532 aa  293  7e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  33.07 
 
 		 530 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  32.68 
 
 		 513 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  38.07 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  32.68 
 
 		 513 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  37.91 
 
 		 529 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  37.3 
 
 		 518 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  37.32 
 
 		 509 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  33.77 
 
 		 540 aa  279  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  33.07 
 
 		 526 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  36.47 
 
 		 544 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  35.28 
 
 		 514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  35.11 
 
 		 506 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  34.61 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  36.46 
 
 		 535 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  31.68 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  31.07 
 
 		 556 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  34.04 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  35.1 
 
 		 509 aa  247  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  34.39 
 
 		 533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  34.79 
 
 		 497 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  34.66 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  30.16 
 
 		 520 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  34.85 
 
 		 523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  36.6 
 
 		 523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  39.37 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  33.87 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  32.32 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  36.67 
 
 		 533 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  34.23 
 
 		 504 aa  229  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  32.74 
 
 		 549 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  33.68 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  32.35 
 
 		 537 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  34.44 
 
 		 523 aa  225  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  31.72 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  32.24 
 
 		 536 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  33.67 
 
 		 528 aa  210  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  32.11 
 
 		 516 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  32.11 
 
 		 516 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  34.52 
 
 		 494 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  32.39 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  30.95 
 
 		 544 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  34.76 
 
 		 575 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  31.31 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  31.45 
 
 		 547 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  33.07 
 
 		 521 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  29.71 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  32.88 
 
 		 603 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  33.42 
 
 		 584 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  32.88 
 
 		 514 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  30.1 
 
 		 523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  30.1 
 
 		 523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  30.1 
 
 		 523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  30.83 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  32.28 
 
 		 569 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  32.97 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2314  hypothetical protein  33.97 
 
 		 613 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  30.8 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  33.11 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  33.11 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  33.11 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  33.11 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  36.14 
 
 		 358 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>