29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2403 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2403  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2362  hypothetical protein  79.09 
 
 		 222 aa  327  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0585  hypothetical protein  29.19 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0560  hypothetical protein  30.06 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  27.4 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2521  hypothetical protein  22.63 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2558  hypothetical protein  22.55 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2556  hypothetical protein  22.06 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.94 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2379  hypothetical protein  23.08 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2612  hypothetical protein  21.57 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2297  hypothetical protein  22.06 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2336  hypothetical protein  22.06 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000839921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2569  hypothetical protein  22.06 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000259293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2369  hypothetical protein  23.53 
 
 		 187 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00037025  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  24.88 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  25.99 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  25.58 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0642  putative fructose transport system kinase  34.55 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  26.51 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  45.61 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0275  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.12 
 
 		 321 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0719547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0955  hypothetical protein  48.78 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  25.48 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0203  deoxynucleoside kinase family protein  33.85 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.25755  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0580  deoxynucleoside kinase  26.42 
 
 		 220 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0594  deoxynucleoside kinase  26.42 
 
 		 220 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4559  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  63.33 
 
 		 307 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3261  FeS assembly ATPase SufC  34.75 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>