77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0560 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0560  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  413  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0585  hypothetical protein  97.52 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00037025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2569  hypothetical protein  30.34 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000259293 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2336  hypothetical protein  30.34 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000839921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2556  hypothetical protein  30.27 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2379  hypothetical protein  30.34 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2612  hypothetical protein  29.78 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2297  hypothetical protein  29.78 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2558  hypothetical protein  29.21 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2521  hypothetical protein  28.9 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2362  hypothetical protein  30.06 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2403  hypothetical protein  30.06 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  24.18 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0098  hypothetical protein  32.14 
 
 		 126 aa  52.8  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  25 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2871  uridine kinase  28.78 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  23.81 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1197  uridine kinase  27.32 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  28.42 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1919  uridine kinase  27.23 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  28.95 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  24.64 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  27.05 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  28.42 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1576  uridine kinase  26.67 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.435743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  26.7 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2552  uridine kinase  25.12 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2453  uridine kinase  25.12 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3195  uridine kinase  25.12 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0472319  hitchhiker  0.00149984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2054  uridine kinase  28.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2349  uridine kinase  26.11 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2356  uridine kinase  26.11 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0747859  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2249  uridine kinase  26.11 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02924  uridine kinase  23.12 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2463  uridine kinase  26.11 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.92076  normal  0.601786 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2228  uridine kinase  24.38 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1979  uridine kinase  26.7 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  hitchhiker  0.00165825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  24.14 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2680  uridine kinase  26.34 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2305  uridine kinase  25.12 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  23.98 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3042  uridine kinase  25.49 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002983  uridine kinase (C1)  23.12 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.163408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0113  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.32 
 
 		 312 aa  45.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2651  uridine kinase  26.18 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.212203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  27.7 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2218  uridine kinase  27.51 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  28.65 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1289  uridine kinase  25.49 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.731499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2617  uridine kinase  26.46 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0169  phosphoribulokinase  25.32 
 
 		 313 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0629486  normal  0.335494 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1657  uridine kinase  26.46 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0722731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1732  uridine kinase  26.46 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000414727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1762  uridine kinase  26.46 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0067733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0556  uridine kinase  23.15 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0365333  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0935  uridine kinase  25.13 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1888  uridine kinase  26.98 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127737  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2456  uridine kinase  26.98 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000511378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  20.09 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2576  uridine kinase  26.98 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0976754  normal  0.0423229 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1079  uridine kinase  25.13 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  24.62 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  25 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  24.14 
 
 		 504 aa  42.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2463  uridine kinase  26.98 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000426115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  26.26 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1408  adenylylsulfate kinase  31.58 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1033  uridine kinase  22.75 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.12732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>