28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2362 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2362  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  427  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2403  hypothetical protein  79.09 
 
 
219 aa  327  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0585  hypothetical protein  30.67 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0560  hypothetical protein  30.06 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2521  hypothetical protein  25.87 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2558  hypothetical protein  26.57 
 
 
186 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2556  hypothetical protein  22.84 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2379  hypothetical protein  22.84 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2336  hypothetical protein  23.38 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000839921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2612  hypothetical protein  25.17 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2569  hypothetical protein  23.38 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000259293 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2297  hypothetical protein  25.17 
 
 
186 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2369  hypothetical protein  24.48 
 
 
187 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00037025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  26.75 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  27.4 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1575  uridine kinase  29.45 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1819  uridine kinase  25 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1820  uridine kinase  25 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1974  uridine kinase  22.89 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1489  uridine kinase  26.23 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0501777  normal  0.122094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0105  putative fructose transport system kinase  30.77 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2244  uridine kinase  28.93 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  30.28 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43766  predicted protein  28.85 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  24.53 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12970  uridine kinase  24.4 
 
 
204 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000147377  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  26.58 
 
 
209 aa  42  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2047  uridine kinase  27.04 
 
 
212 aa  41.6  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.20095  normal  0.647593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>