16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0398 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0398  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0955  hypothetical protein  51.4 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2952  hypothetical protein  67.5 
 
 		 85 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  30.89 
 
 		 533 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1951  putative kinase  27.91 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  48.08 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  46.15 
 
 		 281 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  30.2 
 
 		 427 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83065  Glucokinase  47.22 
 
 		 189 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  41.27 
 
 		 420 aa  41.6  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0597  hypothetical protein  26.9 
 
 		 159 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  30.92 
 
 		 461 aa  41.2  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  44.23 
 
 		 279 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  40.98 
 
 		 443 aa  41.2  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  52.78 
 
 		 468 aa  41.2  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  30.69 
 
 		 525 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>