130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1222 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1077    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  48.39 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  36.98 
 
 		 520 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  36.78 
 
 		 520 aa  306  7e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  36.18 
 
 		 520 aa  299  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  36.98 
 
 		 520 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  35.87 
 
 		 527 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  38.34 
 
 		 518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  37.65 
 
 		 518 aa  263  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  36.45 
 
 		 518 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  31.83 
 
 		 508 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  34.04 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  34.95 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  30.14 
 
 		 504 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  34.9 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  34.17 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  33.66 
 
 		 520 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  33.14 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  32.88 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  34.18 
 
 		 551 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  33.53 
 
 		 556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  30.24 
 
 		 510 aa  233  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  32.75 
 
 		 520 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  33.4 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  33.59 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  30.51 
 
 		 523 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  29.88 
 
 		 513 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  30.04 
 
 		 530 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  29.67 
 
 		 513 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  34.61 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  32.55 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  32.56 
 
 		 518 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  31.49 
 
 		 527 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  33.54 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  35.8 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  33.86 
 
 		 533 aa  216  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  31.15 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  35.67 
 
 		 523 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  32.23 
 
 		 526 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  29.87 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  30.36 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  32.62 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  31.8 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  32.8 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  33.4 
 
 		 508 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  31.45 
 
 		 509 aa  200  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  29.55 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  30.93 
 
 		 544 aa  194  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  33.26 
 
 		 523 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  33.26 
 
 		 523 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  33.26 
 
 		 523 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  32.84 
 
 		 490 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  32.68 
 
 		 498 aa  192  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  32.04 
 
 		 522 aa  189  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  34.29 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  29.56 
 
 		 514 aa  186  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  31.84 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  33.1 
 
 		 516 aa  182  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  31.15 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  30.41 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  32.27 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  32.52 
 
 		 325 aa  181  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  28.27 
 
 		 556 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  31.61 
 
 		 584 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  32.29 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  34.37 
 
 		 494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  30.56 
 
 		 506 aa  170  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  31.79 
 
 		 504 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  30.47 
 
 		 497 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  32.01 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1970  hypothetical protein  30.71 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.971424  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  30.46 
 
 		 549 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  31.3 
 
 		 516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  31.3 
 
 		 516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  29.96 
 
 		 579 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  31.31 
 
 		 535 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  28.82 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  36.59 
 
 		 358 aa  156  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.768295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  32.48 
 
 		 528 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  28.85 
 
 		 523 aa  153  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  28.6 
 
 		 547 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  31.05 
 
 		 514 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  35.03 
 
 		 358 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  30.17 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  29.35 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  30.4 
 
 		 524 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  35.44 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  29.14 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  28.63 
 
 		 536 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  28.95 
 
 		 505 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  28.57 
 
 		 544 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  28.39 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  30.79 
 
 		 603 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  30.14 
 
 		 600 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  30.62 
 
 		 569 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  28.66 
 
 		 526 aa  139  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  30.14 
 
 		 600 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  30.14 
 
 		 600 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  30.62 
 
 		 603 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>