More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0437 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  100 
 
 		 280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  80.88 
 
 		 279 aa  457  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  75.94 
 
 		 281 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  52.65 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  49.1 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  50.57 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  51.67 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  50.56 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  50.56 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  51.13 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  48.7 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  48.16 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  47.79 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  47.1 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  48.33 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  47.6 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  47.43 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  47.21 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.48 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  51.49 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.64 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.64 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  47.99 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  48.15 
 
 		 283 aa  248  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  46.86 
 
 		 284 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  46.13 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  45.96 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  46.32 
 
 		 284 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  45.52 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  47.76 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  45.35 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  47.64 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  47.04 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  50.63 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  45.76 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  44.53 
 
 		 280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  44.81 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  45.76 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  44.85 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  45.39 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  47.01 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  43.49 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  43.87 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  44.61 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  44 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.24 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  43.49 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  51.33 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  43.7 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  44.44 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  44 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  46.1 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  44.44 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  50.44 
 
 		 280 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  43.7 
 
 		 281 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  44.69 
 
 		 285 aa  238  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  45.72 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  44.98 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  44.07 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.69 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  49.56 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.32 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  45.32 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  45.19 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  44.65 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  50 
 
 		 335 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  50 
 
 		 286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  50 
 
 		 286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  50 
 
 		 286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  49.56 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  49.56 
 
 		 280 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  50 
 
 		 280 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  49.56 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  50 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  50 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  50 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  50 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  50 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  49.56 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  49.12 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  50 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.67 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  48.23 
 
 		 280 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  48.67 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  48.23 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  45.56 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  47.79 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.35 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  48.67 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  47.79 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  46.46 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  47.37 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  39.78 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  37.76 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  36.36 
 
 		 345 aa  168  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.04 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.21 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  35.34 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  32.36 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  33.2 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>