35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3226 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  87.08 
 
 		 194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  26.86 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  26.29 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  27.12 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  27.12 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  27.12 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  26.55 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  35.43 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  25.73 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  31.15 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  33.82 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  27.17 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2376  hypothetical protein  29.44 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  31.87 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  35.04 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  32.03 
 
 		 525 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  36.13 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  32.7 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  29.3 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  29.41 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1951  putative kinase  35 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  25.7 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  30.77 
 
 		 529 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2247  putative kinase  32.56 
 
 		 177 aa  44.3  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  28.77 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  30.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  26.98 
 
 		 520 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  26.98 
 
 		 520 aa  42  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0150  shikimate kinase  45.1 
 
 		 178 aa  42  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0955  hypothetical protein  42.5 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0168  shikimate kinase  45.1 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00656319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  50 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  56.25 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  53.12 
 
 		 237 aa  41.2  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>