58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4617 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  100 
 
 		 172 aa  352  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  54.88 
 
 		 195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  50 
 
 		 190 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  50.92 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  50.31 
 
 		 175 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  52.76 
 
 		 169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  51.18 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  53.29 
 
 		 204 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  48.84 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  45.45 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  41.52 
 
 		 198 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  35.67 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  46.25 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 520 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  56.52 
 
 		 51 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  29.03 
 
 		 518 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  27.57 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2576  adenylylsulfate kinase  27.17 
 
 		 220 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  26.77 
 
 		 174 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  20.93 
 
 		 255 aa  44.3  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  24.86 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  28.39 
 
 		 518 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  26.16 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0712  adenylyl-sulfate kinase  25.28 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000090997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  35.48 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  26.16 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  26.16 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0375  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  25.67 
 
 		 619 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435522  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0387  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  25.67 
 
 		 619 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  25.88 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0396  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  25.67 
 
 		 619 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668452  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  28.77 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1145  adenylyl-sulfate kinase  25.41 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  27.78 
 
 		 647 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0210  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  24.43 
 
 		 544 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189837 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  22.35 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1442  adenylylsulfate kinase  25.56 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1514  adenylylsulfate kinase  25.56 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000229121 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1306  adenylylsulfate kinase  25.56 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1305  adenylylsulfate kinase  25.56 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18790  adenylylsulfate kinase ApsK  26.29 
 
 		 376 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1332  adenylylsulfate kinase  25.56 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  29.23 
 
 		 544 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  19.21 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1546  adenylylsulfate kinase  25.56 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2420  adenylylsulfate kinase  28.88 
 
 		 214 aa  42  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2345  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  25.61 
 
 		 638 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1478  adenylylsulfate kinase  25 
 
 		 197 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1584  adenylylsulfate kinase  25.56 
 
 		 197 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4709  adenylylsulfate kinase  28.14 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  26.35 
 
 		 520 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  27.34 
 
 		 525 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3831  adenylyl-sulfate kinase  25 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  26.19 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3866  adenylylsulfate kinase  25 
 
 		 203 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>