12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4540 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  62.75 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  57.69 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  49.06 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  48.15 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  47.27 
 
 		 173 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  44.44 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  54.72 
 
 		 195 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  56.86 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  48.98 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  42.86 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  55.26 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>