41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5732 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  337  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  49.69 
 
 		 190 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  52.47 
 
 		 195 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  51.28 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  54.61 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  54.36 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  53.69 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  48.84 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  47.27 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  50 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  42.5 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  37.33 
 
 		 172 aa  94  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  44.57 
 
 		 97 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  62.75 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  33.82 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  33.82 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  33.09 
 
 		 547 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  30.37 
 
 		 504 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  31.25 
 
 		 512 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  59.09 
 
 		 51 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  28.9 
 
 		 518 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  28.32 
 
 		 518 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0450  adenylylsulfate kinase  28.22 
 
 		 260 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  26.44 
 
 		 527 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  33.82 
 
 		 519 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  51.35 
 
 		 533 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  38.71 
 
 		 528 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  27.13 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  27.56 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2619  adenylylsulfate kinase  27.54 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1028  adenylylsulfate kinase  27.54 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1444  hypothetical protein  24.43 
 
 		 171 aa  42  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.089943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  27.56 
 
 		 174 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  30.53 
 
 		 508 aa  41.6  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  28.28 
 
 		 540 aa  41.2  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2828  hypothetical protein  51.28 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  34.56 
 
 		 521 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  26.89 
 
 		 530 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  27.64 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  29.61 
 
 		 515 aa  40.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>