41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0946 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  338  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  71.26 
 
 
173 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  62.64 
 
 
175 aa  217  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  56.89 
 
 
169 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  52.76 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  54.55 
 
 
195 aa  170  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  49.4 
 
 
190 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  54.05 
 
 
204 aa  159  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  47.27 
 
 
170 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  47.34 
 
 
198 aa  153  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  46.71 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  39.05 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  43.21 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  35.04 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  49.06 
 
 
65 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  34.19 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  34.33 
 
 
155 aa  51.2  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  27.34 
 
 
169 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  44.9 
 
 
68 aa  47.4  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  51.43 
 
 
513 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  28.68 
 
 
504 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  26.92 
 
 
129 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  50 
 
 
490 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  53.33 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  45.71 
 
 
513 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  28.35 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  39.22 
 
 
508 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  25.87 
 
 
174 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  25.87 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  31.96 
 
 
512 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  25.87 
 
 
174 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0038  adenylylsulfate kinase  27.01 
 
 
185 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  22.07 
 
 
200 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14600  predicted kinase  29.79 
 
 
166 aa  41.6  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0408324  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  61.29 
 
 
544 aa  41.6  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  27.01 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  25.87 
 
 
174 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  27.57 
 
 
527 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  48.57 
 
 
523 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0683  shikimate kinase  38.89 
 
 
196 aa  40.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.47245  normal  0.517024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  22.46 
 
 
530 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>