45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02217 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  272  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003544  hypothetical protein  76.74 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1215  hypothetical protein  58.87 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2708  hypothetical protein  50.81 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0834  hypothetical protein  42.97 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000171191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1663  hypothetical protein  29.93 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.039673  normal  0.0367113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2500  hypothetical protein  30.07 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000375646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1844  hypothetical protein  28.86 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000036265  hitchhiker  0.00199391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2507  hypothetical protein  28.86 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000287675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1718  hypothetical protein  29.37 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000386027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2620  hypothetical protein  28.67 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000901127  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1595  hypothetical protein  30.22 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000010265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1643  hypothetical protein  28.47 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000122978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1718  hypothetical protein  29.17 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0029382  normal  0.239872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2336  hypothetical protein  25.17 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  27.96 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1939  hypothetical protein  26.06 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2261  hypothetical protein  29.2 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  26.92 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2808  hypothetical protein  27.46 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1798  hypothetical protein  25.18 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0904  gluconate kinase  37.04 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.119231  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  29 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1844  hypothetical protein  25.87 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000465325  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  28.77 
 
 		 516 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0781  hypothetical protein  34.72 
 
 		 207 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1962  hypothetical protein  32.63 
 
 		 316 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.819299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  58.06 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12559  shikimate kinase  37.5 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121488  normal  0.108726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2646  shikimate kinase  37.5 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1436  hypothetical protein  30.09 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00146467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  29.87 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09800  adenylate kinase-like kinase  32.53 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.501596  normal  0.0564084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2989  hypothetical protein  36.67 
 
 		 282 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000631063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2995  hypothetical protein  36.67 
 
 		 282 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000403811  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0786  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  33.85 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.494269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3422  thymidylate kinase  29.41 
 
 		 203 aa  40.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3640  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  28.21 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  26.79 
 
 		 530 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2690  hypothetical protein  36.67 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000196035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2224  hypothetical protein  36.67 
 
 		 282 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000669165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3757  shikimate kinase  40 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15450  shikimate kinase  39.53 
 
 		 180 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.801598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  52.94 
 
 		 504 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  36.59 
 
 		 184 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>