70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0488 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  100 
 
 
155 aa  306  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  45.95 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14600  predicted kinase  31.16 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0408324  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5366  hypothetical protein  36.29 
 
 
713 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  35.82 
 
 
523 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  25.36 
 
 
255 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  29.01 
 
 
335 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  34.33 
 
 
523 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2476  hypothetical protein  30.37 
 
 
378 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1512  hypothetical protein  28.12 
 
 
146 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.140954  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  21.8 
 
 
255 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2278  hypothetical protein  29.51 
 
 
715 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  34.33 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  21.8 
 
 
264 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  21.8 
 
 
257 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0633  Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase  31.47 
 
 
316 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0439631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31360  hypothetical protein  32.59 
 
 
409 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.559839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2265  hypothetical protein  28.21 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2972  putative phage polynucleotide kinase  33.11 
 
 
302 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  hitchhiker  0.000387567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2134  hypothetical protein  28.89 
 
 
378 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  31.69 
 
 
195 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  31.67 
 
 
535 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  27.56 
 
 
717 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 
586 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  26.19 
 
 
370 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 
484 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  23.87 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
870 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  31.58 
 
 
544 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  20.3 
 
 
260 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5573  metallophosphoesterase  36.3 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  33.7 
 
 
520 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  34.17 
 
 
173 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6082  hypothetical protein  28.86 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  29.13 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  33.61 
 
 
529 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  34.58 
 
 
498 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  29.68 
 
 
518 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  30.66 
 
 
577 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
448 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4619  hypothetical protein  28.7 
 
 
180 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34920  predicted protein  31.4 
 
 
275 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  28.69 
 
 
520 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  30.63 
 
 
834 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  29.25 
 
 
847 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  33.68 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  33.02 
 
 
482 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  32.63 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1257  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 
376 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1043  adenylylsulfate kinase  31.01 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  30.16 
 
 
512 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  36.11 
 
 
498 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  28.44 
 
 
536 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5491  putative phage polynucleotide kinase  34.46 
 
 
330 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334649  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  31.9 
 
 
854 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0594  adenylate kinase  28.7 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1514  polyA polymerase related protein  32.47 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  30.77 
 
 
175 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  32.14 
 
 
600 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  32.14 
 
 
600 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  32.14 
 
 
600 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  32.14 
 
 
600 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  27.91 
 
 
859 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  32.14 
 
 
603 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  32.14 
 
 
603 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  32.14 
 
 
569 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
858 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  33 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>