28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4338 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  100 
 
 
717 aa  1466    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2278  hypothetical protein  36.62 
 
 
715 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5366  hypothetical protein  35.48 
 
 
713 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1045  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  38.73 
 
 
183 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4619  hypothetical protein  37.12 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  31.08 
 
 
858 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  28.97 
 
 
877 aa  53.9  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  28.67 
 
 
857 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  33.08 
 
 
255 aa  52  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
870 aa  51.6  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  39.74 
 
 
137 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  29.23 
 
 
264 aa  50.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  29.73 
 
 
870 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  27.41 
 
 
577 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  27.22 
 
 
859 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  27.33 
 
 
830 aa  48.9  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  27.33 
 
 
448 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  24.83 
 
 
447 aa  48.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  28.77 
 
 
834 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14600  predicted kinase  28.47 
 
 
166 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0408324  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  27.56 
 
 
155 aa  47.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
854 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  27.91 
 
 
260 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  26.92 
 
 
257 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  27.69 
 
 
255 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  25.15 
 
 
864 aa  45.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  30.72 
 
 
852 aa  44.3  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.500527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>