51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_14600  predicted kinase  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0408324  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  39.33 
 
 
834 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  38.76 
 
 
852 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  38.82 
 
 
852 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  35.43 
 
 
852 aa  68.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  34.56 
 
 
853 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  32.89 
 
 
870 aa  67.8  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  36.09 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
858 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  35.54 
 
 
854 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  34.88 
 
 
859 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
863 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  38.39 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  31.33 
 
 
847 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  29.33 
 
 
847 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  31.29 
 
 
448 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  31.16 
 
 
155 aa  61.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  32 
 
 
830 aa  61.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  32.9 
 
 
877 aa  59.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
850 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5573  metallophosphoesterase  35.03 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  27.33 
 
 
870 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
847 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  34.88 
 
 
857 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  28.66 
 
 
447 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  33.73 
 
 
852 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  31.34 
 
 
527 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  32.05 
 
 
484 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  28.67 
 
 
864 aa  50.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  25.83 
 
 
335 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  30.51 
 
 
520 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  26.43 
 
 
255 aa  48.5  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  25.9 
 
 
260 aa  48.9  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  26.62 
 
 
257 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  28.47 
 
 
717 aa  47.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5366  hypothetical protein  28 
 
 
713 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  25.9 
 
 
264 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1043  adenylylsulfate kinase  28.03 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  31.34 
 
 
525 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4619  hypothetical protein  32.52 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44960  hypothetical protein  36.21 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2278  hypothetical protein  30.16 
 
 
715 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2137  hypothetical protein  34.9 
 
 
134 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5049  hypothetical protein  36.45 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1045  hypothetical protein  29.75 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  27.07 
 
 
530 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  36.36 
 
 
577 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  29.79 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05751  DNA kinase/phosphatase (Eurofung)  37.5 
 
 
519 aa  41.2  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.396149  normal  0.010581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 
509 aa  40.8  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  25 
 
 
197 aa  40.8  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>