16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44960 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44960  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  322  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3321  hypothetical protein  43.06 
 
 
347 aa  117  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630565  normal  0.105532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5049  hypothetical protein  45.03 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4050  hypothetical protein  32.03 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5796  putative kinase  33.8 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2088  hypothetical protein  24.22 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000337325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  31.11 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  26.97 
 
 
448 aa  48.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2137  hypothetical protein  29.77 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  28.86 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  32.89 
 
 
335 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14600  predicted kinase  36.21 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0408324  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  30.95 
 
 
484 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2278  hypothetical protein  28.37 
 
 
715 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1781  kinase-like protein  30.6 
 
 
194 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150793  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  29.52 
 
 
576 aa  41.2  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>